Kebun Raya Baturraden terletak di lereng selatan Gunung Slamet, Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah. Luasnya sekitar 143 hektare, berada di ketinggian ±600–750 mdpl. Lokasinya dekat kawasan wisata Baturraden, dengan iklim pegunungan tropis yang sejuk, suhu rata-rata 18–25 °C, serta curah hujan cukup tinggi.
Wilayah kebun raya berbukit dengan kontur bergelombang, tanah vulkanik yang subur, dan aliran sungai kecil yang membelah kawasan. Lanskapnya berpadu dengan hutan pegunungan dan panorama Gunung Slamet, menciptakan ekosistem alami yang kaya.
Koleksi tumbuhan difokuskan pada flora pegunungan Jawa, termasuk tanaman obat tradisional, bambu, anggrek, dan pohon endemik dataran tinggi. Kebun Raya Baturraden juga mengembangkan konservasi tumbuhan langka Jawa Tengah, serta berfungsi sebagai pusat penelitian dan edukasi lingkungan.