Encyclia joaosaiana merupakan tumbuhan dari famili Orchidaceae (suku anggrek-anggrekan). Spesies ini memiliki kebiasaan tumbuh menempel pada batang pohon lain (epifit) dan membentuk umbi semu (pseudobulbous). Tumbuhan ini berasal dari bioma beriklim tropis kering di wilayah Brazil (Bahia). Nama ilmiah Encyclia joaosaiana pertama kali dipublikasikan oleh botanis Marcos Antonio Campacci pada tahun 2008.