Habenaria pygmaea adalah salah satu spesies tumbuhan dari famili Orchidaceae (suku anggrek-anggrekan). Spesies ini memiliki kebiasaan membentuk bonggol berbentuk umbi. Tumbuhan ini berasal dari bioma beriklim tropis basah dengan rentang sebaran mulai dari Venezuela barat daya hingga Ekuador. Nama ilmiah Habenaria pygmaea pertama kali dipublikasikan pada tahun 1954.
POWO (2024). "Plants of the World Online. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet; https://powo.science.kew.org/."
IPNI (2024). "International Plant Names Index. Published on the Internet http://www.ipni.org, The Royal Botanic Gardens, Kew, Harvard University Herbaria & Libraries, and Australian National Herbarium"
