Maxillaria lilliputana merupakan tumbuhan dari famili Orchidaceae (suku anggrek-anggrekan). Spesies ini memiliki kebiasaan tumbuh menempel pada batang pohon lain (epifit) dan membentuk umbi semu (pseudobulbous). Tumbuhan ini berasal dari bioma beriklim tropis basah dengan rentang sebaran mulai dari Ekuador hingga Peru. Nama ilmiah Maxillaria lilliputana pertama kali dipublikasikan pada tahun 1995.